明代李时珍在《证类本草》的基础上，参考了余种文献，又进行了广泛的实地考察、采访和亲自实践，历时二十七载（—年），三易其稿，完成了近万字的科学巨著《本草纲目》。全书52卷，载药种（新增药物种），改绘药图余幅，附方首。
本书将药物按照自然属性分为水、火、土、金石、草、谷、菜、果、木、器服、虫、鳞、介、禽、兽、人共16部60类。每药标正名为纲，纲下分列释名、集解、正误、修制、气味、主治、发明、附方诸项，逐一介绍，以纲系目，条理清晰。尤其是发明项下，主要是介绍李时珍对药物观察、研究和实际应用的新发现、新经验，极大地丰富了本草学的内容。其学术成就有四点
1.该书集16世纪以前本草学之大成。其内容广博，涉及医学、植物学、动物学、矿物学、化学等诸多领域，其影响远远超出了本草学范围。故英国生物学家达尔文称之为“中国古代的百科全书”。
2.该书自年在南京首刊出版后，很快风行全国，17世纪即流传到国外，先后被全译或节译成英、法、德、俄、韩等20多种语言文字，再版余次，在世界广泛流传，成为不朽的科学巨著，是我国科技史上极其辉煌的硕果，在世界科技史永放光辉。英国著名科学史学家李约瑟对其给予了高度评价：“毫无疑问，明代最伟大的科学成就，是李时珍那部在本草书中登峰造极的著作《本草纲目》。李时珍作为科学家，达到了同伽利略、维萨里科学活动隔绝的任何人所不能达到的最高水平。”
3.完备了药物按自然属性分类法，是中古时代最完备的分类系统，它比植物分类学创始人林奈的《自然系统》一书要早多年。
4.年，《本草纲目》作为世界物质文化遗产，与《黄帝内经》同时入选《世界记忆名录》，标志着国际社会对我国中医药文化价值的广泛认同，对推动我国优秀传统文化走向世界具有重要意义。
年，郭沫若为李时珍墓题词：“医中之圣，集中国药学之大成，本草纲目乃一八九二种药物说明，广罗博采，曾费三十年殚精。造福生民，使多少人延年活命！伟哉夫子，将随民族生命永存。”